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强化企业技术创新主体地位。实施普惠政策，鼓励企业加大研发投入。引导企业建立研发准备金制度，政府财政资金给予已建立研发准备金、研发投入持续增长的企业研发经费后补助，补助经费最高1000万元。
全面落实企业研发费用税前加计扣除、高新技术企业税收优惠等政策。放宽享受加计扣除政策的研发活动和费用范围，除规定不宜适用加计扣除的活动和行业外，企业发生的研发支出均可享受加计扣除优惠；在原有基础上，外聘研发人员劳务费、试制产品检验费、专家咨询费及合作或委托研发发生的费用等可按规定纳入加计扣除；允许企业追溯过去3年应扣未扣的研发费用予以加计扣除；简化审核，对加计扣除实行事后备案管理，对可加计扣除的研发费用实行归并核算。
建立现代科研院所治理结构，推动由理事会、学术委员会、管理层各负其责的法人治理结构改革，科研单位取消行政级别。在人员岗位设置、公开招聘人才、职称评审和绩效激励等方面赋予科研机构更大自主权。完善科技成果转化机制，对科技成果转移转化绩效突出的技术转移机构给予奖励和支持。
发挥科技创新支撑引领作用
支持山东半岛自主创新示范区先行先试，加快黄河三角洲农业高新技术产业示范区发展，打造全省创新发展的强大引擎。发挥济南、青岛等科技创新资源集中优势，推动形成科技创新发展的区域中心。高水平建设青岛海洋科学与技术试点国家实验室，尽快成为引领国家海洋科学发展的战略力量。规划并尽快启动山东半岛海洋科技产业聚集区建设，努力打造具有国际影响的山东半岛海洋科技创新中心。加快高新区和经济技术开发区转型发展，构筑科技创新要素集中集聚集约发展的战略高地，支撑各市因地制宜、走特色发展之路，力争“十三五”末，实现国家高新区各市全覆盖。加快农业科技园区布局建设，搭建省级农业科技园、省级农业高新技术产业开发区、国家农业科技园、国家农业高新技术产业示范区梯次发展、互联网+农业科技服务“云农场”互补的农业科技创新园区体系。
组织实施重点科技创新工程，建立重大科技项目联合攻关机制，实现基础研究、应用开发、产业化应用示范一体化部署，“十三五”期间，每年实施50项左右重大科技创新项目，突破一批制约产业发展的共性关键技术，掌握一批重点领域核心技术知识产权，努力形成国家技术标准或国际标准。进一步加强工程技术研究中心、重点实验室建设，实施“十个一百”科技创新品牌培育工程，培育科技创新品牌。
完善支持人才创新机制
支持引进国际国内一流或顶尖人才团队，实行“特事特办、一人一策”，通过项目资助、创业扶持、贷款贴息等方式，给予每个人才团队3000-5000万元综合资助。高层次领军人才创新项目，省级引导基金可给予单个项目最高6000万元的直接股权投资支持。支持科技领军人才发挥作用，建立支持领军人才创新创业的长效机制和荣誉机制，赋予科技领军人才技术路线决策权、人财物支配权和资源调动权。建立科学的人才分类评价机制，加快推动各类创新人才成长。
促进科技和金融紧密结合
加大政府股权投资引导基金支持创新力度。省级引导基金参股子基金投资种子期、初创期科技型企业发生投资损失的，单一项目补偿金额最高可达300万元，单一投资机构年度累计补偿金额最高可达600万元。建立贷款风险补偿机制，鼓励银行机构对省级引导基金及参股子基金投资的挂牌企业项目，在商业化基础上加大贷款支持力度，引导银行机构为科技型中小微企业实施科技成果转化提供资金支持。加大知识产权质押融资力度，发挥好融资杠杆作用，拓宽科技型企业融资渠道，在齐鲁股权交易中心增设科技板块，2016年7月1日后挂牌的科技企业，省级引导基金采取直投方式给予支持。加大科技保险力度，强化科技金融载体建设，探索科技和金融结合的新模式和新路径，建设区域科技金融高地。
构建现代科技服务体系
完善科技服务业支持政策，大力发展科技相关社团机构，培育一批有影响力的中介机构品牌，壮大技术经理人和专利代理人队伍。实行院士工作站、省级众创空间和科技企业孵化器备案制，推动创新创业孵化服务能力提升。提高科技资源共享共用水平，财政投资建设的科研设施，最大限度地向企业、社会组织和科研人员开放。增强“创新券”使用效益，将省科技“创新券”补助范围，扩大到科技型中小微企业接受科技服务所产生的费用；给予首次通过高新技术企业认定的小微企业10万元补助。加快知识产权强省建设，到2020年，全省年发明专利授权量达到3万件。
扩大科技交流合作
在国际科技合作方面，落实国家“一带一路”战略，在国家科技合作协定框架下，加大省科技合作计划实施力度，加强科技合作基地建设，培育国际科技合作品牌。赋予外资研发机构和外籍专家“国民待遇”，符合条件的，允许承担省级科技计划项目，允许申报省科学技术奖。在国内科技合作方面，全面落实与中国科学院、中国工程院合作协议，深化与国内著名高校的多方位合作，促进高水平技术和成果来山东省转化。
